スタートアップにおすすめのクラウド会計2選｜freee・マネーフォワードを徹底比較

スタートアップの立ち上げ期で失敗しやすいポイントの1つが「会計と経理の仕組み化」です。
創業直後は営業・開発・採用などやることが山積みで、経理までは手が回らないという社長がほとんどです。しかし、経理が遅れると 資金繰りの悪化・数字のズレ・融資の失敗・税金の予測不能 など、事業の根幹を揺るがす問題に発展します。

そのため、創業期こそ クラウド会計の導入が必須 です。
本記事では、FLOW会計事務所が数百社のクラウド導入を支援してきた経験をもとに、

freee（フリー）
マネーフォワードクラウド（MF）

の特徴をスタートアップ視点で徹底比較。
あなたの会社に最適なクラウド会計選びをお手伝いします。

■1. 創業期は「クラウド会計が標準」の時代

紙の領収書・Excel帳簿の時代は完全に終わりました。
今の会計業界は “クラウド会計が前提” で動いています。

●クラウド会計がスタートアップと相性抜群な理由

銀行・カードと自動連携で経理が爆速
スマホから経費登録ができる
領収書を撮影するだけで仕訳が作られる
入金・支払いの把握がリアルタイム
決算の精度が高い
税理士・社長が同じ画面で確認できる

「人手が足りない創業期」 ほどクラウドを使う価値が高まります。

■2. freee（フリー）の特徴｜スタートアップとの相性は最強クラス

freeeはUIが圧倒的にわかりやすく、
“会計が苦手な社長でも触れる”ことをコンセプトに作られています。

●freeeのメリット

インターフェースが直感的で使いやすい
バックオフィスをfreeeシリーズで統一できる（給与・人事労務など）
社長が「今会社がどうなってるか」を理解しやすい
小規模〜中規模のスタートアップに特に強い

実際にFLOWでfreeeを導入する会社は、創業1〜2年目でぐんぐん伸びるケースが非常に多いです。

●freeeの注意点

大量仕訳を扱う事業（EC・在庫管理）はやや不向き
細かな会計カスタマイズはMFの方が得意

■3. マネーフォワード（MF）の特徴｜精度と拡張性に強み

「しっかり経理を回したい」「将来の規模拡大も見据えたい」
そんなスタートアップにはMFが向いています。

●MFのメリット

銀行・カードの自動連携が業界トップクラス
税理士が扱いやすく、決算の精度が高い
大量仕訳（EC・広告代理店）にも対応
請求・勤怠・給与・経費精算など周辺機能が強力

“経理の本気度”ではfreeeより上という会社も少なくありません。

●MFの注意点

操作画面はfreeeより少し専門的
初期設定がやや複雑（税理士のサポート必須）

MFは 「成長前提の事業」 に向いています。

■4. freee・MFの使い分けはこう決める

FLOW会計事務所の支援実績から言うと、次の基準でほぼ決まります。

●freeeに向いている会社

社長が自分で触りたい
バックオフィスを一元化したい
UIの直感性を重視
少人数のスタートアップ

●MFに向いている会社

大量の仕訳・取引を扱う
経理担当者がいる
成長による拡張性を重視
決算まで正確に仕組み化したい

結論：
迷ったら freee（操作性重視） or MF（精度・拡張性重視） で間違いありません。

■5. FLOW会計事務所がクラウド導入に強い理由

FLOWはスタートアップに特化した会計事務所として、

freee導入支援：多数
マネーフォワード導入支援：多数
クラウド経理フローの構築実績：300件超

を持っています。

クラウド会計は「入れるだけ」では意味がなく、
入金管理・請求・経費・支払い・振込・給与・経理まで一気通貫のフロー設計 があって初めて成果が出ます。

FLOWでは、導入から運用まで“一気通貫”で仕組み化を代行します。

■まとめ

スタートアップの経理は、創業期ほど早く仕組み化する必要があります。
その核になるのが freee と マネーフォワード の2大クラウド会計です。

操作性・わかりやすさ重視 → freee
精度・拡張性重視 → MF

どちらを選んでも、クラウド導入と経理フローの整備が成功すれば、
資金繰り・経営判断・融資・税金予測など、あらゆる意思決定がスムーズになります。

FLOW会計事務所では、クラウド導入から経理フロー構築までワンストップで対応しています。創業期の経理に不安がある方は、お気軽にご相談ください。